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分析流程
多组学联合分析:RNA-seq + ATAC-seq/CUT&Tag
整合 RNA-seq 差异表达、ATAC-seq 开放染色质和 CUT&Tag 组蛋白修饰/转录因子结合信号,解释基因表达变化背后的调控机制。
Multi-omics机制解释与多组学调控
软件与算法
DESeq2
基于负二项分布的 RNA-seq 差异表达分析 R 包,适合有生物学重复的 bulk RNA-seq。
差异表达分析R 包
分析流程
Bulk RNA-seq 标准差异表达分析增强版
面向 bulk RNA-seq 项目的标准差异表达增强流程,覆盖实验设计、FASTQ 质控、STAR/Salmon 定量、DESeq2 统计建模、可视化、富集分析与结果交付。
RNA-Seq转录组基础与表达变化